의료공학 BioEngineering
[의료공학/Bioengineering] Gene Expression 유전자 발현
사전적 정의 유전자 발현(遺傳子發現, 영어: gene expression)은 DNA를 구성하는 유전 정보, 즉 유전자에 의해 생물을 구성하는 다양한 단백질이 형성되는 과정이다. -위키백과 Transcriptomics DNA(Genotype) ---(Transcription)--> RNA --(Translation)--> Protein --> Phenotype 사람의 몸을 구성하는 세포들은 모두 같은 DNA를 가지지만, 각 세포들은 모두 서로 다릅니다. 이는 transcription pattern이 서로 다르기 때문에 세포의 기능과 생김새가 다른 것. (transcriptomics 영역!) Transcription and Translation DNA와 RNA의 차이는 DNA: 정적 (chromosome 2..
[의료공학/BioInformatics] Sequence Alignment
Alignment Algorithms -Global Alignment 비슷한 사이즈의 두 sequence align Needleman-Wunch 알고리즘 -Local Alignment 크기에 상관없이 두 sequence align 전체 시퀀스의 best match of sub-sequences를 찾기. Smith-Waterman 알고리즘 두 알고리즘 모두 다이나믹 프로그래밍에 근거한다.(동적계획법) 피보나치 수열이 동적계획법의 가장 대표적 예시다. Manhattan Tourist Problem Longest common Subsequence
[의료공학/BioInformatics] Genome Sequencing
Genome sequencing은 4가지 단계의 반복이다. cut, amplifying, sequencing, aligning 1. Cutting: Restriction Endonuclease Restriction Endonuclease는 DNA를 특정 site에서 자른다. 2. Amplifying: Bacterial Artificial Chromosome(BAC) 큰 genome sequencing을 위해 사용(인간 게놈 같은) genome을 150-350kbp 길이로 자르고, 박테리아에 삽입하고, 키운다. Amplifying: Polymer Chain Reaction(PCR) BAC는 in vivo(in life)에 많은 작업이 필요해 작은 작업에는 안 어울린다. PCR는 dna를 in vitro에 ..
[의료공학/BioEngineering] RNA, Protein Coding, Gene
Ribonucleic Acid(RNA) RNA는 DNA와 비슷하게 4개의 nucleotides의 sequence다. DNA는 double-strand, RNA는 single-strand. DNA는 A,C,T,G를 RNA는 Adenine,Cytosine,Uracil,Guanine를 쓴다. DNA가 RNA보다 훨씬 stable하다. deoxy, no hydroxyl group때문에 DNA는 static genetic material, RNA는 temporal, dynamic effective material. RNA 종류 세포에는 다른 종류의 RNA가 존재한다. messenger_mRNA: transfers information from the genome into proteins by translation..
[의료공학/Bioengineering]Gene Expression 유전자 발현
DNA —> Enzyme(protein) —> Phenotype Transcription and TranslationDNA-(transcription)->RNA-(translation)->Protein->Phenotype 유전자 정보는 DNA에서 RNA로 그리고 단백질로 흐른다. 유전자는 기능적 RNA와 단백질의 청사진 역할을 하는 DNA의 구역입니다. DNA는 뉴클레오타이드(nucleotide)로 구성되어 있고 단백질은 아미노산으로 구성되어 있기 때문에, DNA에 암호화되어 있는 정보를 단백질로 변환하는 매개자가 필요합니다. 이 매개자는 전령RNA(messenger RNA, 줄여서 mRNA)입니다 mRNA는 전사(transcription)라고 불리는 과정을 통해 DNA의 청사진을 복사합니다. 진핵생물(..